一艘菲律宾货轮在香港泊岸，海关人员循例登船检查，突然遇袭，一名匿藏船上的男子Gary打伤海关人员，逃到岸上。接连数日在码头附近发生多宗凶杀案，受害人有警员、市民，甚至黑帮人物，凶手身份及行凶动机未明。香港警队杨丽青督察接手调查，她从各点蛛丝马迹中推断，行凶者与当日逃走的Gary有关。该轮船的船长Captain与弟John指称Gary是他们在公海救起的难民，其人失忆及有暴力倾向。警方高层向杨丽青下达指示，要对此暴徒加紧追捕，必要时，为了全港市民的安宁着想，可执行格杀令。疑凶Gary四处躲藏警方的缉捕，由于失忆，对自己过去的一切完全空白，加上对香港陌生，本能上只懂得以暴力自卫，变成千夫所指的头号危险人物。杨丽青加紧追查行动，从线报得知Gary藏于一妓女家中，杨丽青精密布置，准备将他一举擒获，怎料在现场连船长之弟John亦一并逮住。在扣留期间，警方严词逼供，John一直保持缄默。

一夜，John与Gary双双越押，令警方大为震惊。惟杨丽青在拘捕Gary的过程中，发现Gary本是一个善良的人，一切暴行只属自卫，杨丽青深信另有内情，继续追查，得悉菲律宾货轮实为海盗船，船上的大副阿强才是凶案幕后元凶。可惜，杨丽青苦无证据，上司当然不相信她的片面之词，至于杨丽青所说的海盗嫁祸罪名于Gary，更被指斥为无蹊。事实上，Gary乃公海劫案的唯一生还者，被海盗扣押，幸而他与海盗船上的John乃旧时好友，遂得以逃脱，却被海盗陷害他杀人，而John亦因海盗群的追究要逃命。杨丽青眼见Gary与John两命无辜者被定为凶徒，而货轮则依期离港，一群海盗逍遥法外，竟无计可施。另一方面，Gary从自己及John上的海狼纹身，开始渐有记忆，杨丽青遂掌握到重要线索，实行大举歼灭真正的奸徒的重任。