八神太一、石田大和、武之内素娜、城户丈、泉光子郎、太刀川美美、高石武、八神嘉儿这八位小朋友，在夏令营中受到召唤而到进入数码世界进行冒险。1999年，由于数码世界资料异常增生，导致数码世界和现实世界的连接发生紊乱。地球上相应地出现奇怪的自然现象：东南亚没有下雨，池塘全部干涸中东却因为连场大雨发生洪水美国则遇到有史以来最寒冷的夏天，日本则突降大雪。11岁的少年八神太一和他的六个朋友一起参加了夏令营，却奇怪的被神秘地送到了一个多彩的数码世界。在那里，他们得到了叫做“数码宝贝”的搭档。这些孩子被认为是数字世界的未来，他们与数码宝贝们一起要解开控制这个可怕的数码世界之谜。当他们踏上这个伟大的征程时，因特网成了他们的战场……